اجرای قاطع حکم اسلام
سال 1367 منافقینی که در زندان بودند به صورت تاکتیکی اعلام توبه کردند ، اما پس از پذیرش قطعنامه و همزمان با حمله منافقین به ایران از طریق قصر شیرین ، این عده نیز در زندان آشوب کرده و شروع به آتش زدن زندان کردند تا به زعم خود وبا رسیدن منافقین به تهران٬ پروسه اشغال تهران را کامل کرده و کار را یکسره کنند. به دنبال این اقدام منافقین بود که امام فرمودند : آنهائی که بر سر موضع نفاق هستند مهدورالدمند و باید محاکمه و مجازات شوند.
به دنبال آن و با نظر خواهی از حضرت امام (ره) در این خصوص ، ایشان حکمی به این شرح صادر کردند :" از آنجا که منافقین خائن به هیچ وجه به اسلام معتقد نبوده و هرچه می گویند از روی حیله و نفاق آنهاست و به اقرار سران آنها ٬از اسلام ارتداد پیدا کرده اند ،باتوجه به محارب بودن آنها و جنگ کلاسیک آنها در شمال و غرب و جنوب کشور با همکاری های حزب بعث عراق و نیز جاسوسی آنها برای صدام علیه ملت مسلمان ما و با توجه به ارتباط آنان با استکبار جهانی و ضربات ناجوانمردانه آنان از ابتدای تشکیل نظام جمهوری اسلامی تاکنون ، کسانی که در زندان های سراسر کشور بر سر موضع نفاق خود پافشاری کرده و می کنند محارب و محکوم به اعدام می باشند و تشخیص موضوع نیز در تهران با رأی اکثریت آقایان حجت الاسلام نیری دامت افاضاته ( قاضی شرع ) و جناب آقای اشراقی ( دادستان تهران ) و نماینده ای از وزارت اطلاعات می باشد ،اگر چه احتیاط در اجماع است و همین طور در زندان های مراکز استان کشور رأی اکثریت آقایان قاضی شرع ، دادستان و یا دادیار و نماینده وزارت اطلاعات لازم الاتباع می باشد.
رحم بر محاربین ٬ ساده اندیشی است ، قاطعیت اسلام در برابر دشمنان خدا از اصول تردید ناپذیر نظام اسلامی است ، امیدوارم با خشم و کینه انقلابی خود نسبت به دشمنان اسلام رضایت خداوند متعال را جلب نمائید ، آقایانی که تشخیص موضوع به عهده آنان است وسوسه و شک و تردید نکنند و سعی کنند اشداء علی الکفار باشند . تردید در مسائل قضائی اسلام انقلابی نادیده گرفتن خون پاک و مطهر شهداء می باشد .والسلام ".
با صدور حکم اعدام در مورد منافقین و مرتدین از دین اسلام تردیدی نسبت به منافقین تازه دستگیر شده به وجود آمد که مرحوم سید احمدآقا طی نامه ای از امام ، در خصوص افراد یاد شده نیز سؤال کردند و پاسخ امام در این مورد به این شرح بود :
"بسمه تعالی
در تمام موارد فوق هرکس در هر مرحله اگر بر سر نفاق باشد حکمش اعدام است . سریعا دشمنان اسلام را نابود کنید . در صورت رسیدگی به وضع پرونده ها در هر صورت که حکم سریعتر اجرا گردد همان مورد نظر است .
قاطعیت امام در برخورد با منافقین و سپس رسیدگی و صدور حکم در این مورد توسط دستگاه قضائی جمهوری اسلامی تا آنجا مهم و قابل ذکر بود که توانست تا حد بسیار زیادی ، بازوی عمل منافقین در جمهوری اسلامی را از پا در آورد.
حمایت صریح روشنفکرترین زن اصلاحات از گروهک رجوی
زهرا رهنورد ( همسر میر حسین موسوی ) در مصاحبه با سایت خودنویس ، پیرامون سرکوب گروهک تروریستی منافقین و اعدام اعضای آن در سال 1367 ، که به دستور قاطع امام خمینی (ره) صورت گرفت ، بیان داشت که این ها ، خطائی بزرگ و کج روی غیر قابل اغماض بوده است و لکه های سیاهی است که با آب زمزم و کوثر نمی توان سفید کرد .
.... انتقام جوئی طرف مقابل {نظام} خطای بزرگی بوده است و قابل قبول یا اغماض نیست !!
کجایی شیر مرد...هر جا هستی خدا به همراهت.